В 1685 году игумен монастыря иеромонах Пафнутий показал под присягою место Троицкого Мотронинского монастыря, который был разрушен во время нашествия хана Батыя.
В 1991 году первые насельницы поселились на месте Свято-Троицкого Мотронинского монастыря, которые начали своим трудом воздвигать монастырь с нуля: отреставрировали разрушенную церковь, построили жилые корпуса, создали большое подсобное хозяйство.
